More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1575 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  694    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  34.8 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 686 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 686 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 286 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 284 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  39.64 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  27.05 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.91 
 
 		 1418 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  30.63 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  30.63 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  33.33 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5309  helix-turn-helix domain-containing protein  22.55 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.446177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 537 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3846  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 531 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  31.53 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  25.68 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  31.37 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2734  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000030307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  33.67 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  22.42 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  33.07 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  32.54 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>