More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0876 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  99.67 
 
 
351 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  99.67 
 
 
323 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  100 
 
 
299 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  95.32 
 
 
323 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  84.95 
 
 
313 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  84.95 
 
 
313 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  84.95 
 
 
313 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  84.62 
 
 
313 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  70.11 
 
 
295 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  69.89 
 
 
296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  60.78 
 
 
296 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  37.15 
 
 
296 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 
333 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 
333 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  40.49 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 
312 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 
326 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
368 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 
329 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  30.28 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.76 
 
 
325 aa  95.5  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 
332 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 
357 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
319 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  29.68 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  25.15 
 
 
318 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 
343 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
382 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.16 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  28.3 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  37.61 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0422  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
241 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  36.36 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  28.74 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1500  helix-turn-helix domain-containing protein  40.48 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.546441  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0839  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  43.9 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0360  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 
131 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  31.08 
 
 
1376 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  22.12 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  39.76 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  30.83 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>