More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0117 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.25 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2540  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  25.58 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3031  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000013989  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  39.71 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  42.35 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  29.5 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  25.39 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  37.65 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  46.84 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 156 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  31.72 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  22.31 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2863  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  32.35 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  24.1 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>