More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3259 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  40.06 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  34.59 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  40.16 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  35.88 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  34.85 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  33.33 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  33.33 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  33.33 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  35.82 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  38.1 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  36.5 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  39.24 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  32.54 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  36.52 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  33.07 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  33.66 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  33.66 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  27.08 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>