More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0679 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 333 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  66.26 
 
 		 377 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  65.64 
 
 		 377 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2540  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  29.83 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  28.38 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  24.83 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  37.95 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  29.19 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3031  AraC family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000013989  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  20.96 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  24.38 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.95 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  23.19 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  25.17 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  34.65 
 
 		 1298 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2187  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 752 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.97772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  37.8 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.35 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  38.14 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  21.6 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  19.71 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1419  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00505932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>