More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4246 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  27.13 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  22 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  22 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 281 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 281 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  21.89 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  21.6 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  23.48 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  24.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  22.62 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  24.51 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  26.67 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  24.06 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6455  transcriptional regulator, AraC family  20.87 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  23.17 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  20.41 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  25.4 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  20.07 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  20.07 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  20.16 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  20.72 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  22.18 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  20.08 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  22.62 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  23.92 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  22 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  25.1 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  19.62 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  21.19 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  20 
 
 		 275 aa  72  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  22.9 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  19.34 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  22.05 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  22.71 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  21.4 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>