More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1250 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  43.78 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  43.37 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  36.51 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  34.92 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  32.48 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  32.77 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 293 aa  88.6  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  44.66 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  36.22 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  47.83 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 353 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  48.81 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  36.53 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  46.74 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  34.52 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  29.55 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  27.64 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  46.24 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  41.49 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>