More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0769 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 266 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2022  transcriptional regulator, AraC family  34.89 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0521834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  36.15 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  22.75 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  41.9 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.14 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 427 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  29.73 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 409 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  22.67 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  21.71 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.86 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  25.96 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  21.71 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  30.93 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  29.81 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  30.87 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  28.72 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 344 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.7 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2405  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.269245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2452  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0494728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>