More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4321 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4321  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  727    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3358  hypothetical protein  34.87 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 904 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  34.69 
 
 		 1335 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  33.33 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  23.24 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  32.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  22.08 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0332  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  30.39 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00257  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.67 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0352  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3303  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0268  putative HTH-type transcriptional regulator YkgA  33.67 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0313  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3321  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00261  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 287 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  23.68 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.48 
 
 		 1366 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  21.15 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  31.65 
 
 		 1373 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 940 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  33.01 
 
 		 1376 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  31.63 
 
 		 1374 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 1201 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  34.34 
 
 		 993 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.3 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8442  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 539 aa  63.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  26.61 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  35.63 
 
 		 1378 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  30.91 
 
 		 1374 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  38.38 
 
 		 1384 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>