More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8442 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8442  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 320 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  26.56 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  32.92 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 335 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.12 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  33.12 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 199 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  23.95 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  24.43 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.6 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.9 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  36.3 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  37.32 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  36.21 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  25.25 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  28.17 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  34.53 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  26.49 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>