More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1536 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  100 
 
 		 310 aa  637    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3956  putative regulatory protein  26.56 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0244269  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4063  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 271 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.453209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3876  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4001  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.940351  normal  0.48087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3892  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03436  putative regulatory protein  24.59 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4950  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 271 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03387  hypothetical protein  24.59 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3907  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.869248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  22.76 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0844  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  21.72 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  34.58 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 519 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 548 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 440 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 539 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 535 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 408 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 408 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  22.14 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  22.82 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  25.55 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 773 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  31 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.82 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.68 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  21.99 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 502 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 766 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 507 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  27.37 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0309  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  39.53 
 
 		 1296 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>