More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2509 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  587  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  24.13 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  20.51 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  29.08 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.86 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  27.86 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  20.97 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  21.92 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  36.56 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  36.56 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  24.22 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 144 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.94 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  31.58 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 140 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  18.68 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  32.08 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  19.37 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>