More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2321 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 317 aa  652    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.27 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  40.43 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  36 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  35.64 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  42.16 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  35.87 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  36.17 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.95 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  26.14 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.79 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0188  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0526  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  31.58 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  31.68 
 
 		 1306 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.2 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3607  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>