More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6833 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  91.51 
 
 		 259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  76.36 
 
 		 257 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  68.11 
 
 		 255 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  68.11 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  67.72 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 255 aa  341  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 256 aa  334  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  69.14 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  69.14 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  66.54 
 
 		 257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  30.04 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  28.3 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.69 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  28.87 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  32.64 
 
 		 250 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  31.33 
 
 		 250 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  32.42 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  32.19 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  36.36 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  36.36 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  36.36 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  36.36 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.84 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  35.05 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  36.36 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  35.42 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 325 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2618  hypothetical protein  23.29 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  38.53 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  37.78 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  37.78 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  23.29 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 437 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.03 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.5 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  36.96 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>