More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0893 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0893  putative HTH-type regulatory protein, AraC family  100 
 
 		 284 aa  597  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.364356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  67.97 
 
 		 279 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  66.19 
 
 		 280 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  66.55 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1275  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2519  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3614  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.950607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02292  predicted DNA-binding protein  33.21 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02253  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1287  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2672  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2534  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2751  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.91 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  34.91 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  34.91 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  34.91 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 365 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 544 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 532 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 430 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 531 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3841  transcriptional activator RhaR  32.97 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3753  transcriptional activator RhaR  32.97 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.890732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 523 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0738  transcriptional activator RhaR  32.97 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0386443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 519 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 544 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 509 aa  68.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 773 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 409 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 		 412 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.55 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 779 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  34.78 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 533 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  24.79 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  27.85 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>