More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2890 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 300 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.56 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  21.46 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  31.25 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  23.27 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  34.48 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  33.79 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  33.79 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  33.79 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  33.79 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.17 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  40.78 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  30.22 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  20.92 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 686 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 686 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4449  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.943681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0928  AraC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 77 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 1201 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.43 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  19.08 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  31.78 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  34.74 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  24.12 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  23.16 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>