More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4449 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4449  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 439 aa  919    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.943681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4458  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 278 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4621  transcriptional regulator ArgR  37.36 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52740  transcriptional regulator ArgR  37.36 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  34.65 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34510  ArgR-like transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1831  transcriptional regulator ArgR  35.42 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2912  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3771  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128178  normal  0.013148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4287  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  41.05 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3566  helix-turn-helix, AraC type  35.42 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3987  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4482  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 316 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1433  helix-turn-helix domain-containing protein  35.16 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392956  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  37.89 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 318 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  35.79 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  35.79 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 312 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 293 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 338 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.48 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 338 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  35.48 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  33.33 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 202 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>