More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0928 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0928  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 77 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  97.4 
 
 		 285 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 283 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  48 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  48.65 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  45.33 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  40.85 
 
 		 287 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  39.47 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  40.85 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 356 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 291 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 287 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  43.84 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004105  signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 1125 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01362  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1141 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 1201 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  44.29 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2099  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.88 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0478327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  44.29 
 
 		 332 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  36.62 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 517 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  38.67 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  42.25 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  36.62 
 
 		 307 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 		 298 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 238 aa  60.5  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 288 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.48 
 
 		 415 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 318 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 339 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 332 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 332 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  39.44 
 
 		 350 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 350 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 332 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 267 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  40.79 
 
 		 300 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 286 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 1121 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  36.99 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  38.03 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  45.61 
 
 		 1296 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  38.03 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.57 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  40.85 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 330 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.25 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  39.73 
 
 		 530 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 548 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 533 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 345 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>