55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2800 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2800  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  547  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 336 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 330 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 317 aa  92  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  21.58 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.31 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  20.87 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  28.5 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 391 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 325 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 389 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  20.15 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  20.85 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.37 
 
 		 342 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  24.37 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 351 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 338 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 338 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.15 
 
 		 385 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  21.91 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  27.01 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>