More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4405 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 434 aa  833    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 331 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 326 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  36.04 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 330 aa  156  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  31.8 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 318 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 318 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  29.64 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 329 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 369 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 369 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 369 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 332 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 131 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 131 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 131 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  44.74 
 
 		 118 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 362 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 336 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.64 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  28.77 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.22 
 
 		 314 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  35.17 
 
 		 322 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.42 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  33.57 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  33.79 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  32.88 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 339 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  38.05 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2365  hypothetical protein  25.64 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>