More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0762 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  90.23 
 
 
477 aa  801    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  90.85 
 
 
481 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  90.83 
 
 
480 aa  799    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  100 
 
 
478 aa  946    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  90.23 
 
 
477 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  90.64 
 
 
481 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  90.23 
 
 
477 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  49.06 
 
 
477 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  49.06 
 
 
477 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  49.06 
 
 
475 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  42.33 
 
 
483 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  42.33 
 
 
483 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  44.06 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
519 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
519 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
519 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
519 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
519 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 
519 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 
519 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  37.84 
 
 
477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  39.51 
 
 
451 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 
468 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 
118 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 
319 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  37.96 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 
373 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 
322 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 
131 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 
131 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 
131 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  32.32 
 
 
350 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 
350 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 
350 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  35.46 
 
 
198 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  32.32 
 
 
350 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
341 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 
331 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
341 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
341 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  31.31 
 
 
350 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  32.32 
 
 
350 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
302 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
345 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  32.32 
 
 
350 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  32.32 
 
 
350 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 
326 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
338 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0768217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.31 
 
 
350 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 
350 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  31.31 
 
 
350 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  31.31 
 
 
350 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 
326 aa  63.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  31.31 
 
 
350 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  31.31 
 
 
350 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 
329 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
328 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
344 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
335 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
334 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
335 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
335 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
336 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 
321 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 
392 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
344 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 
318 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 
327 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
344 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
316 aa  60.1  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
343 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
338 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  36.78 
 
 
342 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
330 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
349 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
327 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>