294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01953 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  100 
 
 		 451 aa  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  39.29 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 477 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 477 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 475 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  39.51 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  38.06 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  38.06 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  38.06 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  37.92 
 
 		 481 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  37.74 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  37.55 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  35.2 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  35.2 
 
 		 483 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  35.2 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  35.51 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  42.53 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  31.78 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  31.78 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  31.78 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  31.78 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  31.78 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  31.37 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 316 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  29.6 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  31.01 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  30.23 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  30.23 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.23 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  30.23 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  30.23 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  30.23 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  33.96 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.64 
 
 		 338 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  29.46 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 131 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 131 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 131 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>