More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5068 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
324 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  84.57 
 
 
324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  87.04 
 
 
324 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  86.96 
 
 
324 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  86.65 
 
 
324 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  85.49 
 
 
324 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4738  AraC family transcriptional regulator  83.4 
 
 
290 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  57.19 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  34.97 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 
330 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 
327 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
352 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
341 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
327 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
368 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 
327 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
327 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 
336 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  32.77 
 
 
318 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 
326 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
333 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 
333 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 
326 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
343 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 
362 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
336 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  27.56 
 
 
329 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  27.6 
 
 
321 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  27.04 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  29.45 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 
321 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.83 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  28.74 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 
319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  27.84 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  41.41 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.64 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.52 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>