More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4724 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  99.71 
 
 		 348 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  99.71 
 
 		 348 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  42.12 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  41.29 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  39.19 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  36.16 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  35.83 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 131 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 131 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 131 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  52.34 
 
 		 118 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 319 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 369 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.86 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 332 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  41.28 
 
 		 326 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  24.45 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  45.19 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  28.46 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  28.65 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  37.5 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  33.81 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  44.23 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.81 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  42.59 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.26 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>