271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3472 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  41.48 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  32.91 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 434 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  32.4 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2365  hypothetical protein  35.15 
 
 		 205 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  32.28 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 131 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 131 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 131 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.92 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  43.56 
 
 		 118 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  32.9 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.95 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  34.95 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  29.68 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  34.95 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  33.98 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  36.63 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  27.01 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  26.26 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  25.87 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>