More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2988 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2988  transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  54.29 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  52.7 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  55.7 
 
 		 323 aa  311  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  51.27 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  50.96 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  52.41 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  48.29 
 
 		 356 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  46.5 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  48.41 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  48.58 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  48.58 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  46.82 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  47.94 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  45.57 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 		 321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  45.74 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  45.43 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  43.67 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  43.35 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  44.87 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  44.59 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  45.91 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.4 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  43.59 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  43.35 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 331 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  43.27 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  40.99 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  40.97 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  38.85 
 
 		 335 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 		 352 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 346 aa  225  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  41.08 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 334 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  43.53 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  43.23 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  40.76 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  40.76 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  40.76 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  40.76 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  40.76 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  40.75 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  40.76 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  42.44 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  40.39 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  40.13 
 
 		 321 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  43.49 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  41.9 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  40.71 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  39.49 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  40.45 
 
 		 318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  40.63 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  35.99 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  40.89 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  40.26 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  40.26 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  40.44 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  40.19 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  40.38 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>