More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3601 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 304 aa  635    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  79.61 
 
 		 304 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  67.4 
 
 		 297 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  67.4 
 
 		 297 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  64.45 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  66.09 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  63.85 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  57.04 
 
 		 299 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 299 aa  348  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  56.68 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  56.68 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  56.68 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 318 aa  348  8e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  56.68 
 
 		 318 aa  348  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 299 aa  332  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  52.54 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  47.93 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 296 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  43.34 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  43.05 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  40.91 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.43 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  36.81 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  42.11 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  39.11 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  38.72 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  40.44 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  39.03 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  38.7 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  40.86 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  37.21 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  34.19 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  38.31 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  33.67 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  37.7 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  40.93 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  37.01 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  37.18 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>