More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3041 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  99.04 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  92.53 
 
 		 318 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  89.81 
 
 		 314 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  89.49 
 
 		 314 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  89.81 
 
 		 314 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  81.79 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  82.11 
 
 		 321 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  81.79 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  81.79 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  81.79 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  81.79 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  82.11 
 
 		 314 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  80.51 
 
 		 314 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  83.66 
 
 		 295 aa  477  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  72.82 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  71.13 
 
 		 322 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  70.38 
 
 		 322 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 297 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  53.29 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 315 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  53.92 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  53.4 
 
 		 321 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 323 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  51.82 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 323 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 323 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 296 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  47.65 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  43.49 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  45.21 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  45.2 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  43 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  43 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  43 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  41.5 
 
 		 312 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  40.47 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  37.2 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  43.17 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 288 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.79 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  39.93 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  38.81 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  38.46 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  35.76 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  38.06 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2978  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  38.65 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  37.94 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  37.23 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  36.43 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>