More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0587 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  69.2 
 
 
297 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  56.83 
 
 
315 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  57.93 
 
 
315 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  60 
 
 
322 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  59.66 
 
 
322 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  58.64 
 
 
321 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  57.81 
 
 
314 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  57.48 
 
 
314 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  56.58 
 
 
328 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  57.48 
 
 
314 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  57.48 
 
 
314 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  57.48 
 
 
314 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  57.48 
 
 
314 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  58.84 
 
 
325 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  57.44 
 
 
314 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  57.97 
 
 
321 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  56.71 
 
 
323 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  55.89 
 
 
323 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  61.89 
 
 
314 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  59.66 
 
 
316 aa  333  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  54.83 
 
 
323 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  61.54 
 
 
314 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  61.94 
 
 
318 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  60.9 
 
 
314 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  60.9 
 
 
314 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  53.44 
 
 
311 aa  332  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  55.07 
 
 
323 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  55.4 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  60.55 
 
 
314 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  55.4 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  54.88 
 
 
323 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  51.04 
 
 
310 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  50.86 
 
 
296 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  48.15 
 
 
295 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  54.55 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  48.26 
 
 
297 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  48.26 
 
 
297 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  48.03 
 
 
304 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  48.23 
 
 
304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  43.89 
 
 
318 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 
375 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.49 
 
 
318 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  45.3 
 
 
299 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  43.49 
 
 
318 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 
318 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  43.49 
 
 
318 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 
318 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  45.3 
 
 
299 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 
299 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  45.99 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  47.46 
 
 
318 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  46.24 
 
 
329 aa  252  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  44.22 
 
 
346 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  46.32 
 
 
305 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  44.33 
 
 
310 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
306 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
294 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  44.48 
 
 
292 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 
296 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  39.25 
 
 
300 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
301 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  36.46 
 
 
297 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  40.49 
 
 
301 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 
301 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
301 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  39.72 
 
 
297 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  39.45 
 
 
297 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 
301 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 
306 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  35.71 
 
 
302 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 
302 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  39.02 
 
 
289 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  37.16 
 
 
307 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
306 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  37.37 
 
 
289 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  37.83 
 
 
312 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  34.48 
 
 
293 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 
303 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  36.23 
 
 
312 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 
314 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  31.72 
 
 
307 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  34.04 
 
 
293 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  36.96 
 
 
307 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
303 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 
311 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
312 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 
321 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 
310 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
302 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 
329 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 
306 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>