More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05946 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  82.25 
 
 		 293 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  66.67 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 296 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  39.45 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 294 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  41.85 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  38.72 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 314 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  40.89 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  40.08 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  39.11 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.11 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  39.11 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  39.11 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  39.11 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  34.56 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  36.9 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 346 aa  178  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  34.95 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 323 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  38.65 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  39.04 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  37.14 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  34.62 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  35.32 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  31.99 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  34.43 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  36.99 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  34.04 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  31.83 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  32.96 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  34.47 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  31.62 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>