More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7040 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  98.14 
 
 		 323 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  98.14 
 
 		 323 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  90.71 
 
 		 323 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  87.31 
 
 		 323 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  89.61 
 
 		 323 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  78.64 
 
 		 323 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  68.42 
 
 		 321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  61.31 
 
 		 310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  68.18 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 315 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  63.75 
 
 		 315 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 297 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 346 aa  332  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  52 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  52 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 325 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  50.17 
 
 		 310 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  48.44 
 
 		 312 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  46.71 
 
 		 295 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  45.33 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  42.53 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  42.07 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.41 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  41.41 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  42.96 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 299 aa  225  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  41.61 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  37.24 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  40.57 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.28 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  37.67 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  36.68 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  37.93 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  35.6 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  34.81 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  33.46 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  30 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  34.93 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  34.75 
 
 		 390 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  35.45 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>