More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0669 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 305 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  67.4 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  66.79 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  68.09 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  61.4 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  60.69 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  61.4 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  61.4 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  61.4 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  59.11 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  54.17 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 346 aa  278  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  46.6 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  43.71 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  43.49 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 296 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  38.35 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  36.84 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 295 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  37.72 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  37.69 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  36.19 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  37.23 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  38.95 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  37.24 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  37.05 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  36.3 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  37.79 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  37.76 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  36.3 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  35.59 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  36.53 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  34.14 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>