More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4475 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  47.22 
 
 		 297 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  47.22 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  43.46 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  45.64 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.58 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  39.58 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 375 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 346 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  38.51 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 323 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  35.76 
 
 		 294 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  36.11 
 
 		 293 aa  188  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  35.54 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  38.87 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  36.52 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  34.56 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  39.29 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  35.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  33.57 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 315 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  36.29 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 321 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  32.75 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  33.1 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3074  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.618991  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2738  AraC-type transcriptional regulator domain protein  30.67 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  31.45 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  31.97 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2598  transcription regulator protein  33.96 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  31.79 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2283  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>