More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2256 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  627  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  36.36 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  36.18 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 329 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 303 aa  191  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  35.27 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  37.02 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  33.79 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  33.69 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0810  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  32.89 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  37.19 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2591  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.04 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2283  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  34.58 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 329 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2712  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.974943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.47 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  34.47 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  35.74 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  36.36 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  35.11 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  33.7 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3052  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  34.81 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  37.15 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>