More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2008 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 315 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  93.02 
 
 		 315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 321 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  63.52 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  60 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  62.71 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 322 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  57.09 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 314 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 314 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  54.52 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 314 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 314 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  47.9 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  46.05 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 312 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 375 aa  242  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.4 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  44.4 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  43.05 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  42.18 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  42.6 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  35.09 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  40.21 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.83 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  37.89 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  35.93 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  35.52 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  36.36 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  36.97 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  36.24 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  36.3 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  35.74 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  35.74 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>