More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46400 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  73.31 
 
 		 323 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 323 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  71.57 
 
 		 323 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 323 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 		 315 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  69.84 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  64.94 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  60.19 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 297 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  52.72 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  52.79 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 314 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  50.34 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  47.26 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  48.63 
 
 		 312 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 295 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  43.34 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 375 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  44.03 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.33 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  41.33 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  41.92 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  40.34 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  42.6 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  41.13 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  35.76 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  39.79 
 
 		 297 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  37.72 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  39.57 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  33.79 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  34.81 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  37.73 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  35.71 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  36.4 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  34.74 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  35.93 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.65 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  35.08 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>