More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08000 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.389173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  51.31 
 
 		 278 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23500  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  53.93 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23720  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  49.44 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  50.56 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5487  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 214 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6896  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 760 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  38.04 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  27.91 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.37 
 
 		 530 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  24.85 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  37.08 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  37.3 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.12 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1103  helix-turn-helix domain-containing protein  27.37 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.403298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  37.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.14 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  36.26 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  36.14 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4504  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2165  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  37.21 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.68 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>