More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0667 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0667  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  577  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  58.63 
 
 		 285 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0847  AraC family transcriptional regulator  58.51 
 
 		 280 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 285 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  57.91 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0166  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3708  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6066  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  22.48 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.23 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  29.88 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  29.88 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  26.95 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  38.14 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.39 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  24.48 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.43 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  23.39 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  30.06 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  30.39 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  20.55 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  33.72 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>