More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2180 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 295 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  57.91 
 
 		 298 aa  346  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  54.11 
 
 		 300 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  56.27 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  47.26 
 
 		 298 aa  299  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1405  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.099769  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  45.15 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  45.39 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10093  putative AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  43.37 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0841  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489932  normal  0.458947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  42.03 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.91 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2714  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  41.16 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  41.16 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.58 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4017  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176614  hitchhiker  0.00151279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  38.85 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  41.43 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6274  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6699  transcriptional regulator, AraC family  39.57 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3745  helix-turn-helix domain-containing protein  39.15 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3525  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3644  transcriptional regulator, AraC family  38.77 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  39.66 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1308  helix-turn-helix domain-containing protein  38.21 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  37.77 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5730  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.861702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6134  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  36.58 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4380  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.072515  decreased coverage  0.000817798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3929  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0730  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4603  transcriptional regulator, AraC family  52.38 
 
 		 87 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.463016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  30.64 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  41.46 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2240  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  24.38 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  40 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 550 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  26.94 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3534  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0611769  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1550  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4278  helix-turn-helix domain-containing protein  26.34 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4826  helix-turn-helix domain-containing protein  26.29 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0623  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378679  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  40.24 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3374  helix-turn-helix domain-containing protein  25.19 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 600 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>