More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2709 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  69.77 
 
 		 296 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  36.64 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  36.45 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  35.47 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  34.44 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  33.56 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  33.1 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  31.83 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  34.81 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  31.72 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  37.24 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  33.89 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.17 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.17 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.17 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.17 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.17 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  31.82 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  31.82 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.82 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.94 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  31.77 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  33.99 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 281 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4241  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.82932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 280 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  25.49 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  36.8 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  25.6 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5055  transcriptional regulator AraC family  27.59 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  22.59 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  22.6 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1809  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.19 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000134184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  21.4 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>