More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07776 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4241  transcriptional regulator, AraC family  46.72 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.82932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5352  transcriptional regulator, AraC family  40.29 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20713  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 282 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5271  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0620952  normal  0.0372935 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2210  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.423817  normal  0.20032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 295 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0263  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  27.89 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  42.42 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  33.12 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1346  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  23.87 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  34.45 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0826  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1447  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  37.5 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0938  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.210407  normal  0.519262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>