More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4803 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  92.31 
 
 		 299 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5055  transcriptional regulator AraC family  40.67 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  37.98 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  37.21 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  36.5 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  33.77 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  37.3 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  37.88 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  37.88 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  37.88 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  40.57 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  40.57 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  40.57 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  40.57 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  40.57 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  33.08 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  25 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  39.83 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  26.39 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2210  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.423817  normal  0.20032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4241  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.82932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  35.58 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>