More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4017 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 295 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  37.63 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  35 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  35.89 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  35.91 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  34.12 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  35.91 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  35.52 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  34.16 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  35.12 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  34.93 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  36.16 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  30 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  31.11 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  31.11 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.11 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  26.18 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.29 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.29 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.29 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.29 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.29 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  32.28 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 293 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5541  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3857  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  25.38 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3260  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  45.63 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2769  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  24.72 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  24.19 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  37.67 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  23.51 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>