50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0730 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0730  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 115 aa  241  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  65.38 
 
 		 298 aa  157  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  51.89 
 
 		 300 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  48.08 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  57.78 
 
 		 297 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 295 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 302 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  47.25 
 
 		 300 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1405  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 		 305 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.099769  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 303 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10093  putative AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6699  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 303 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  43.02 
 
 		 307 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.66 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2714  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 305 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0841  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 302 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489932  normal  0.458947 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 303 aa  73.6  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3525  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 305 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 306 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6274  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 305 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 305 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5730  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 305 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.861702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4017  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176614  hitchhiker  0.00151279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 302 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1308  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 300 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 304 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3745  helix-turn-helix domain-containing protein  36.47 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6134  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3929  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 305 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.38 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3644  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4380  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.072515  decreased coverage  0.000817798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 312 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>