More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6702 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1405  transcriptional regulator, AraC family  56.48 
 
 		 305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.099769  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  51.75 
 
 		 300 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  47.67 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  47.52 
 
 		 298 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  47.85 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10093  putative AraC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  45.77 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  46.95 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  44.59 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  46.4 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  47.65 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  45.02 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  45.91 
 
 		 305 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  41.78 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  48.11 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  46.26 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4380  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.072515  decreased coverage  0.000817798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  45.36 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  46.21 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  42.14 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6699  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1308  helix-turn-helix domain-containing protein  43.39 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0841  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489932  normal  0.458947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.63 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2714  transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4017  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176614  hitchhiker  0.00151279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3644  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  44.78 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3525  transcriptional regulator, AraC family  42.62 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3745  helix-turn-helix domain-containing protein  42.81 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5730  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.861702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  43.33 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6274  transcriptional regulator, AraC family  42.6 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  42.18 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.37 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  43.32 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6134  transcriptional regulator, AraC family  41.95 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3929  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4603  transcriptional regulator, AraC family  58.33 
 
 		 87 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.463016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0730  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 115 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1694  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3374  helix-turn-helix domain-containing protein  25.19 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6379  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  25.98 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0890  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.82 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2696  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  45.24 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1158  transcriptional regulator, AraC family  42.7 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4278  helix-turn-helix domain-containing protein  26.69 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  43.02 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  20.64 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  25.72 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  39.02 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5517  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0042541  normal  0.0106671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  43.21 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0470  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4701  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0485  transcriptional regulator, AraC family  25.4 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2240  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0938  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.210407  normal  0.519262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6410  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>