More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4722 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  76.76 
 
 		 285 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  75.63 
 
 		 285 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0847  AraC family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 280 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0667  helix-turn-helix domain-containing protein  58.63 
 
 		 297 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0166  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3708  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6066  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.85 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  42.86 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  29.06 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  33.79 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  26.16 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.33 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  31.13 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  22.41 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  42.31 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>