More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3020 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3020  histidine kinase  100 
 
 
631 aa  1313    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 
1022 aa  207  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 
785 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  40.59 
 
 
998 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
970 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
575 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
791 aa  200  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
386 aa  197  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
1003 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  41.85 
 
 
910 aa  193  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
573 aa  193  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
641 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
631 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
569 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
927 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
977 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
1214 aa  185  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
579 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
574 aa  181  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
596 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
646 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
858 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1857 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
1839 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  35.97 
 
 
810 aa  178  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 
557 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
581 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1433 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 
991 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  33.79 
 
 
1392 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1816 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
917 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  37.54 
 
 
1695 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
1400 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1482 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1201 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1158 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
2099 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
1964 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1203 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1406 aa  171  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
798 aa  170  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
767 aa  170  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
1917 aa  170  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
975 aa  170  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1782 aa  170  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
2099 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1037 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
633 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
1271 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
796 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
1680 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
1954 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
1843 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
1853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
763 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
1847 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.03 
 
 
1653 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
974 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 
1143 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
875 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
932 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  36.93 
 
 
288 aa  167  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
1361 aa  167  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1896 aa  167  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
687 aa  167  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
1195 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
833 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
1125 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  40.73 
 
 
1125 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  32.67 
 
 
882 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 
1363 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
778 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
1313 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1237 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
1303 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 
801 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1942 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3157  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
859 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1362 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
1959 aa  164  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.87 
 
 
923 aa  164  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
763 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
699 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  41.78 
 
 
615 aa  164  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
763 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1479 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
2010 aa  163  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
759 aa  163  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
1124 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
1165 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
810 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
743 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
1691 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
995 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  37.61 
 
 
792 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
1937 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>