More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0693 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0693  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  28.33 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  48.65 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  36.25 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  20.26 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4352  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00646909  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0562  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 271 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 306 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  17.84 
 
 		 519 aa  52.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 278 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 276 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 295 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 299 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 300 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 296 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  20.95 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  21.78 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  31.25 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  29.79 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 336 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  23.3 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 322 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 302 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  40.22 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 361 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  23.75 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  23.75 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.38 
 
 		 303 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 316 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 355 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  32.91 
 
 		 284 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.13 
 
 		 300 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 294 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 318 aa  48.5  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  30 
 
 		 275 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  23.78 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>