More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6130 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 269 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4352  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00646909  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  46.91 
 
 		 160 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 296 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.7 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  39.74 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  43.24 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5999  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 382 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 355 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  43.37 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.51 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  42.27 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2884  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  25.61 
 
 		 529 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  24.18 
 
 		 529 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.71 
 
 		 530 aa  55.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  38.27 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 123 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 360 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7370  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.660604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 532 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.93 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.22 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>