More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5740 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5740  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3649  helix-turn-helix domain-containing protein  80 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  76.38 
 
 		 256 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5321  helix-turn-helix domain-containing protein  76.52 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.833678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5690  AraC family transcriptional regulator  76.52 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3684  helix-turn-helix domain-containing protein  77.46 
 
 		 287 aa  343  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1434  AraC family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 257 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1452  AraC family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 257 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5080  transcriptional regulator, AraC family  38.4 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2796  helix-turn-helix domain-containing protein  36.93 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6884  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2317  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2575  hypothetical protein  30.49 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0213  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5394  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2373  transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0015649  normal  0.589788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3351  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.37 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4467  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3297  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  27.43 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1743  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295048  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3822  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2303  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02039  putative DNA-binding protein  24.03 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4807  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 221 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55240  hypothetical protein  31.86 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3877  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0671  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  43.62 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15970  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  48.24 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2709  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.263272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1998  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.11 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2432  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3204  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19869  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  34.65 
 
 		 387 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 347 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  33.33 
 
 		 348 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 349 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1060  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0590  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.988044  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1738  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 347 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2863  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 349 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 346 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2729  AraC family transcription regulator  33.33 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2428  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  36.27 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  28.91 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 410 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0730  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000385534  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>